More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5117 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5117  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 320 aa  606  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0627  transcriptional regulator, LacI family  35.74 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.958953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0417  LacI family transcription regulator  34.22 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  36.66 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2799  transcriptional regulator, LacI family  34.71 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4014  Alanine racemase  37.54 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.251479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2545  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.02 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3955  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337972  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  36.52 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.35 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01740  transcriptional regulator  34.5 
 
 		 355 aa  115  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0742  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.13843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  29.85 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2164  LacI family transcription regulator  35.85 
 
 		 347 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1304  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  26.59 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1318  LacI family response repressor  30.09 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.119217  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22460  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.912929  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  30.06 
 
 		 344 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  31.55 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1506  LacI family response repressor  28.19 
 
 		 338 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  27.81 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1322  LacI family response repressor  30.3 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.465092  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1292  transcriptional regulator, LacI family  27 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  24.11 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4286  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  24.03 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0911  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  24.18 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  25.52 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4341  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  23.7 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  27.33 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3965  LacI family transcription regulator  23.7 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  32.04 
 
 		 334 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5149  transcriptional regulator, LacI family  31.29 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  26.8 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  26.14 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0306  LacI family transcription regulator  28.22 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4322  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  23.7 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4113  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  23.38 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4433  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  23.38 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4230  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  23.38 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  30.53 
 
 		 366 aa  99.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4066  LacI family transcription regulator  24.04 
 
 		 325 aa  99  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  24.47 
 
 		 335 aa  99  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  27.76 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  25.83 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3954  LacI family transcription regulator  22.73 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.647552  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  27.38 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  26.35 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  27.6 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  27.54 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0074  LacI family transcription regulator  30.09 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.840414  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  29.91 
 
 		 353 aa  96.3  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 		 362 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  23.51 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  23.28 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  31.18 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  26.63 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  27.38 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.39 
 
 		 325 aa  92.8  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  26.27 
 
 		 335 aa  92.8  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  31.42 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  26.25 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1853  LacI family transcription regulator  29.52 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0619869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 355 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  24.77 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  27.33 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1488  LacI family response repressor  30.28 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  26.21 
 
 		 341 aa  90.9  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  26.32 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  29.55 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  28.98 
 
 		 351 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  27.33 
 
 		 339 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  32.43 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  28.12 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  29.34 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  27.65 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.73 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  26.01 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  25.66 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  23.26 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0956  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.93 
 
 		 346 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  28.7 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  25.98 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.71 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  29.51 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  30.88 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1489  LacI family response repressor  29.3 
 
 		 256 aa  87.4  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  27.27 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  26.47 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.18 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  31.14 
 
 		 384 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  29.24 
 
 		 348 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  28.06 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  28.06 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  26.95 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  22.89 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2354  LacI family transcription regulator  29.75 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756754  normal  0.112701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>