More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0956 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0956  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 326 aa  647    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  44.51 
 
 		 361 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  43.16 
 
 		 336 aa  222  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 364 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6854  transcriptional regulator, LacI family  43.52 
 
 		 330 aa  208  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000835434  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  40.37 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  38.53 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0032  Alanine racemase  40.18 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19154  normal  0.0639211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2876  transcriptional regulator, LacI family  38.51 
 
 		 342 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.900808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  32.42 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  37.76 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  38.1 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3537  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.234016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  36.25 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.91 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.29 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.016252  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4618  regulatory protein LacI  34.86 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.93 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  32.93 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  34.76 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.53 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  35.95 
 
 		 337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  37.87 
 
 		 339 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0663  transcriptional regulator, LacI family  35.17 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  37.27 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  31.04 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3611  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.24 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0436  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.24 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0128  transcriptional regulator, LacI family  37 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  37.91 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 353 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  32.93 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0425  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.888688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.82 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  32.22 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.28 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 343 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.66 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 346 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  35.35 
 
 		 365 aa  149  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  33.63 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  33.64 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2472  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  31.07 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  33.64 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  33.64 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  33.64 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  33.54 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1093  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 351 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  35.65 
 
 		 334 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  34.34 
 
 		 349 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2762  transcriptional regulator, LacI family  35.5 
 
 		 339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6530  transcriptional regulator, LacI family  34.65 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00751965 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  30.54 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.18 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.93 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 368 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2764  alanine racemase  33.03 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.93 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5610  transcriptional regulator, LacI family  34.95 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.21 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.61 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4409  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  36.45 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  33.54 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3792  transcriptional regulator LacI family  32.84 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  34.15 
 
 		 358 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  31.95 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  32.45 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.85 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  37.26 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  31.71 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>