More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_3734 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3751  GABA permease  98.06 
 
 
487 aa  598  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00254323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3734  GABA permease  100 
 
 
309 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9528e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3570  GABA permease  99.03 
 
 
464 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1479  GABA permease  98.71 
 
 
449 aa  597  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10983  hitchhiker  0.00182133 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3468  gamma-aminobutyrate permease  99.03 
 
 
464 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3482  gamma-aminobutyrate permease  99.03 
 
 
464 aa  599  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3489  GABA permease  98.71 
 
 
464 aa  599  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3853  GABA permease  99.03 
 
 
464 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.261193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3774  GABA permease  99.03 
 
 
464 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3823  GABA permease  97.41 
 
 
464 aa  595  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1317  GABA permease  78.64 
 
 
465 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.319742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3893  amino acid permease-associated region  64.08 
 
 
472 aa  404  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.375275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4133  amino acid permease-associated region  64.71 
 
 
472 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2876  GABA permease  57.65 
 
 
463 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975083  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2921  GABA permease  55.99 
 
 
463 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3600  GABA permease  57 
 
 
587 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0494  GABA permease  57.65 
 
 
463 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2583  GABA permease  57.65 
 
 
463 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0522  GABA permease  57.65 
 
 
463 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3572  GABA permease  57 
 
 
467 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0956  GABA permease  57 
 
 
467 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0426  GABA permease  57.33 
 
 
463 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1926  GABA permease  57 
 
 
467 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.620655  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0660  GABA permease  57 
 
 
467 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3590  GABA permease  57 
 
 
541 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.566491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0452  GABA permease  57.33 
 
 
463 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131648  normal  0.0220043 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0515  GABA permease  57 
 
 
467 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3371  amino acid permease-associated region  57.28 
 
 
606 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3382  amino acid permease-associated region  57.28 
 
 
606 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3433  amino acid permease-associated region  57.28 
 
 
606 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5356  gamma-aminobutyrate permease  55.63 
 
 
463 aa  348  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4909  GABA permease  55.3 
 
 
463 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3609  GABA transporter  56.68 
 
 
463 aa  346  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0284  GABA permease  56.29 
 
 
461 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  hitchhiker  0.000157703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2780  GABA permease  55.3 
 
 
463 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2911  GABA permease  55.3 
 
 
463 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.582601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10533  gaba permease gabP (4-amino butyrate transport carrier)  55.02 
 
 
434 aa  344  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0307  GABA permease  55.96 
 
 
461 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220085  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0302  GABA permease  55.96 
 
 
461 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1998  amino acid permease-associated region  55.88 
 
 
608 aa  342  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.89102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2523  amino acid permease-associated region  59.35 
 
 
464 aa  342  5e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2872  GABA permease  54.97 
 
 
463 aa  341  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2021  amino acid permease-associated region  56.83 
 
 
480 aa  336  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3753  amino acid permease-associated region  55.87 
 
 
478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109507  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1805  amino acid permease-associated region  57.7 
 
 
469 aa  336  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607317  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2906  gamma-aminobutyrate transporter  56.11 
 
 
466 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2938  gamma-aminobutyrate transporter  56.11 
 
 
466 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.111546 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3095  gamma-aminobutyrate transporter  56.11 
 
 
466 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2973  gamma-aminobutyrate transporter  56.11 
 
 
466 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  0.0482196 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2990  gamma-aminobutyrate transporter  56.11 
 
 
466 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0122  amino acid permease-associated region  59.02 
 
 
606 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0313  GABA permease  56.44 
 
 
463 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3218  gamma-aminobutyrate transporter  54.02 
 
 
466 aa  329  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1020  GABA permease  54.02 
 
 
466 aa  329  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2798  gamma-aminobutyrate transporter  54.02 
 
 
466 aa  329  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1043  gamma-aminobutyrate transporter  54.02 
 
 
466 aa  329  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2783  gamma-aminobutyrate transporter  54.02 
 
 
466 aa  329  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.414998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02519  gamma-aminobutyrate transporter  53.7 
 
 
466 aa  328  7e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02483  hypothetical protein  53.7 
 
 
466 aa  328  7e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3905  gamma-aminobutyrate transporter  53.7 
 
 
466 aa  328  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.667666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2943  gamma-aminobutyrate transporter  53.7 
 
 
466 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0906  amino acid permease-associated region  52.32 
 
 
468 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3570  amino acid permease-associated region  56.77 
 
 
460 aa  320  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2293  GABA permease  52.13 
 
 
468 aa  319  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114117  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4926  GABA permease  54.64 
 
 
461 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4114  GABA permease  52.81 
 
 
463 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7767  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4525  amino acid permease-associated region  54.89 
 
 
473 aa  316  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.411369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0667  amino acid permease-associated region  51.62 
 
 
464 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.450649  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4627  amino acid permease-associated region  51.3 
 
 
463 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000229605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0786  amino acid tranporter  50.66 
 
 
459 aa  311  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4765  amino acid permease-associated region  50.97 
 
 
463 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4756  amino acid permease  50.97 
 
 
463 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000433889  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3171  amino acid permease-associated region  50.81 
 
 
470 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.12607  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2543  amino acid ABC transporter permease  50.81 
 
 
470 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0431573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2038  amino acid permease-associated region  50.81 
 
 
470 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.948577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2616  amino acid permease-associated region  51.32 
 
 
464 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923502  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3459  amino acid permease-associated region  50.33 
 
 
459 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4907  amino acid permease-associated region  50.33 
 
 
459 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492814  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5379  amino acid permease-associated region  50.33 
 
 
459 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0243202  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2214  amino acid permease-associated region  50.16 
 
 
469 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3325  amino acid permease-associated region  48.54 
 
 
471 aa  305  9.000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4364  amino acid permease-associated region  53.31 
 
 
476 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0686  beta-alanine/gamma-aminobutyrate-H+ symporter  53 
 
 
483 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6223  amino acid permease-associated region  52.55 
 
 
481 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2002  amino acid transporter  54.89 
 
 
473 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01580  gamma-aminobutyrate permease  53.47 
 
 
475 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683743  normal  0.83882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0205  gamma-aminobutyrate permease  53.47 
 
 
475 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1447  amino acid permease-associated region  46.73 
 
 
460 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302331  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3380  amino acid permease-associated region  52.49 
 
 
460 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  45.48 
 
 
464 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  46.13 
 
 
462 aa  292  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4407  amino acid ABC transporter permease  46.41 
 
 
460 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0417319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4106  amino acid ABC transporter permease  52.16 
 
 
460 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1758  amino acid permease-associated region  52.16 
 
 
460 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174265 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3679  amino acid permease-associated region  52.16 
 
 
460 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.720671  hitchhiker  0.00000622895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2188  amino acid permease-associated region  50 
 
 
491 aa  289  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000662916  hitchhiker  0.000260404 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  48.71 
 
 
513 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  48.71 
 
 
474 aa  285  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  48.71 
 
 
474 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  45.37 
 
 
472 aa  285  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>