More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0519 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0519  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  877    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.306862  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  69.27 
 
 		 427 aa  614  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  69.27 
 
 		 469 aa  611  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  67.61 
 
 		 442 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1688  seryl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2665  seryl-tRNA synthetase  64.3 
 
 		 427 aa  569  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  64.65 
 
 		 431 aa  566  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1490  seryl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.693524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2702  seryl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 436 aa  514  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  58.31 
 
 		 435 aa  515  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0722  seryl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 426 aa  508  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0586  seryl-tRNA synthetase  58.78 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 426 aa  508  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2787  seryl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4234  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 428 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1795  seryl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4604  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 428 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0441  seryl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4753  seryl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 428 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3185  seryl-tRNA synthetase  57.74 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2742  seryl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 476 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51517  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0453  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393606  normal  0.0512779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0957  seryl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4404  seryl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2517  seryl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0204633  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1791  seryl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 470 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.419973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4414  seryl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 442 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.866176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0637  seryl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0919244  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 423 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6577  seryl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 435 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7399  seryl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2282  seryl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 467 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1070  seryl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1863  seryl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 431 aa  458  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.517326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3115  seryl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 474 aa  455  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132725 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0437  seryl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0193411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0028  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 425 aa  448  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2429  seryl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0994  seryl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0584  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0454  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.730155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 426 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  50.47 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 426 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1697  seryl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 426 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0685581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 435 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 438 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 426 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1844  seryl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0308873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1477  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1402  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 426 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  48.49 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 426 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2755  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 426 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 426 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 426 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>