More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6577 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4234  seryl-tRNA synthetase  82.26 
 
 		 428 aa  718    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4604  seryl-tRNA synthetase  82.03 
 
 		 428 aa  717    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6577  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 435 aa  872    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7399  seryl-tRNA synthetase  88.79 
 
 		 437 aa  728    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2282  seryl-tRNA synthetase  75.17 
 
 		 467 aa  645    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4753  seryl-tRNA synthetase  81.84 
 
 		 428 aa  717    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2787  seryl-tRNA synthetase  70.28 
 
 		 434 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3185  seryl-tRNA synthetase  70.97 
 
 		 434 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4404  seryl-tRNA synthetase  65.59 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2702  seryl-tRNA synthetase  69.52 
 
 		 436 aa  586  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2742  seryl-tRNA synthetase  64.84 
 
 		 476 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51517  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0586  seryl-tRNA synthetase  69.8 
 
 		 461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1791  seryl-tRNA synthetase  67.02 
 
 		 470 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.419973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4414  seryl-tRNA synthetase  67.5 
 
 		 442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.866176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  65.89 
 
 		 435 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2517  seryl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 481 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0204633  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  64.77 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  62.96 
 
 		 427 aa  544  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  63.19 
 
 		 469 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1688  seryl-tRNA synthetase  62.96 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  62.96 
 
 		 442 aa  538  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  62.84 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1490  seryl-tRNA synthetase  62.27 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.693524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2665  seryl-tRNA synthetase  60.88 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873953  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1776  seryl-tRNA synthetase  58.7 
 
 		 497 aa  525  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0925083  decreased coverage  0.00473675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3115  seryl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 474 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  60.97 
 
 		 425 aa  524  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  59.86 
 
 		 426 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0722  seryl-tRNA synthetase  60.79 
 
 		 426 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0519  seryl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 425 aa  496  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.306862  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1795  seryl-tRNA synthetase  59.36 
 
 		 430 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0637  seryl-tRNA synthetase  61.57 
 
 		 425 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0919244  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0957  seryl-tRNA synthetase  59.95 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0441  seryl-tRNA synthetase  59.13 
 
 		 430 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1070  seryl-tRNA synthetase  56.72 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0453  seryl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393606  normal  0.0512779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  58.33 
 
 		 423 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0437  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0193411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0994  seryl-tRNA synthetase  55.68 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0028  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2429  seryl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 430 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 426 aa  435  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1863  seryl-tRNA synthetase  55.43 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.517326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0454  seryl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.730155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0584  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01077  seryl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06242  seryl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13316  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 428 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 431 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 434 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 427 aa  418  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1477  seryl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1402  seryl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  53 
 
 		 424 aa  415  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 430 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>