More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0010 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  100 
 
 		 427 aa  880    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  63.59 
 
 		 424 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  64.75 
 
 		 422 aa  578  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 423 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  65.09 
 
 		 424 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  63.03 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  63.68 
 
 		 424 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  64.42 
 
 		 423 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  62.29 
 
 		 424 aa  551  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  63.25 
 
 		 424 aa  554  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  62.11 
 
 		 421 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  61.81 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  61.81 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  60.66 
 
 		 423 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 422 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  61.81 
 
 		 424 aa  547  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  61.34 
 
 		 424 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  63.07 
 
 		 420 aa  545  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  61.67 
 
 		 424 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  60.52 
 
 		 427 aa  537  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  61.88 
 
 		 423 aa  532  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  61.85 
 
 		 422 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 423 aa  533  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  59.81 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 424 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 425 aa  527  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  59.95 
 
 		 432 aa  524  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 425 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 425 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  59.24 
 
 		 422 aa  520  1e-146  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  58.77 
 
 		 422 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 423 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 425 aa  511  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  56 
 
 		 427 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 422 aa  501  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 426 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  57.18 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 430 aa  498  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 427 aa  498  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 427 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 425 aa  489  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 426 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 425 aa  482  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 428 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 428 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 435 aa  484  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  56.47 
 
 		 423 aa  480  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 426 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 424 aa  474  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 436 aa  478  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 427 aa  472  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 426 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 427 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 426 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 426 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 426 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 426 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 428 aa  471  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  55 
 
 		 426 aa  470  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 426 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 426 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 421 aa  471  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 426 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 426 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>