More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2342 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  91.8 
 
 		 427 aa  819    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 442 aa  916    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1688  seryl-tRNA synthetase  74.94 
 
 		 427 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  90.25 
 
 		 469 aa  821    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  73.54 
 
 		 427 aa  653    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2665  seryl-tRNA synthetase  75.88 
 
 		 427 aa  666    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  76.8 
 
 		 431 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1490  seryl-tRNA synthetase  73.77 
 
 		 427 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.693524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0519  seryl-tRNA synthetase  67.61 
 
 		 425 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.306862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2702  seryl-tRNA synthetase  66.21 
 
 		 436 aa  598  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  65.72 
 
 		 426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0586  seryl-tRNA synthetase  65.62 
 
 		 461 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4753  seryl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 428 aa  569  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4604  seryl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4234  seryl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 428 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 435 aa  562  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 425 aa  560  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1795  seryl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 430 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0441  seryl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 430 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4404  seryl-tRNA synthetase  59.44 
 
 		 468 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0453  seryl-tRNA synthetase  61.7 
 
 		 430 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393606  normal  0.0512779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4414  seryl-tRNA synthetase  62.47 
 
 		 442 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.866176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2742  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 476 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51517  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2787  seryl-tRNA synthetase  62.59 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0637  seryl-tRNA synthetase  63.68 
 
 		 425 aa  534  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0919244  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7399  seryl-tRNA synthetase  64.52 
 
 		 437 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38893  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3185  seryl-tRNA synthetase  62.67 
 
 		 434 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1791  seryl-tRNA synthetase  58.72 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.419973  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0722  seryl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6577  seryl-tRNA synthetase  62.96 
 
 		 435 aa  524  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0957  seryl-tRNA synthetase  60.6 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2282  seryl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 467 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3115  seryl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1070  seryl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 430 aa  510  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2517  seryl-tRNA synthetase  56.04 
 
 		 481 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0204633  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0437  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 424 aa  507  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0193411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2429  seryl-tRNA synthetase  60.28 
 
 		 430 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 423 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1863  seryl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 431 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.517326 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0994  seryl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 430 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0028  seryl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 425 aa  478  1e-134  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 425 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  56.37 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 426 aa  467  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 428 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 428 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 435 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  53.63 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  54.99 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 427 aa  458  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 430 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 428 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 428 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0454  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.730155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06242  seryl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13316  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1417  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 430 aa  458  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0584  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01077  seryl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  53 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1666  seryl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.746595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 422 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 427 aa  451  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 427 aa  450  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>