More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4604 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4234  seryl-tRNA synthetase  99.53 
 
 		 428 aa  871    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4604  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 428 aa  875    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7399  seryl-tRNA synthetase  82.57 
 
 		 437 aa  669    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6577  seryl-tRNA synthetase  82.03 
 
 		 435 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2282  seryl-tRNA synthetase  78.4 
 
 		 467 aa  697    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4753  seryl-tRNA synthetase  94.86 
 
 		 428 aa  832    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2787  seryl-tRNA synthetase  70.37 
 
 		 434 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2742  seryl-tRNA synthetase  64.21 
 
 		 476 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51517  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3185  seryl-tRNA synthetase  69.91 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4404  seryl-tRNA synthetase  65.17 
 
 		 468 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2702  seryl-tRNA synthetase  67.9 
 
 		 436 aa  584  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1791  seryl-tRNA synthetase  64.24 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.419973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4414  seryl-tRNA synthetase  67.05 
 
 		 442 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.866176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  66.04 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  66.75 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  66.98 
 
 		 469 aa  568  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  65.57 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0586  seryl-tRNA synthetase  66.22 
 
 		 461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64934 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 442 aa  555  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2517  seryl-tRNA synthetase  61.8 
 
 		 481 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0204633  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1688  seryl-tRNA synthetase  64.15 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  65.59 
 
 		 431 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2665  seryl-tRNA synthetase  63.68 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1490  seryl-tRNA synthetase  63.68 
 
 		 427 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.693524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  62.06 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3115  seryl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 474 aa  508  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  60.28 
 
 		 426 aa  508  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0722  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0441  seryl-tRNA synthetase  59.07 
 
 		 430 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1795  seryl-tRNA synthetase  59.3 
 
 		 430 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0637  seryl-tRNA synthetase  62.26 
 
 		 425 aa  494  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0919244  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 423 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0957  seryl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 433 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0453  seryl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 430 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393606  normal  0.0512779 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0519  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 425 aa  490  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.306862  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0437  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0193411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1070  seryl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 430 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0994  seryl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1863  seryl-tRNA synthetase  57.88 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.517326 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2429  seryl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_002978  WD0028  seryl-tRNA synthetase  52 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0454  seryl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 423 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.730155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0584  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 423 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 428 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 424 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 438 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  50.7 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06242  seryl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 449 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13316  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 426 aa  421  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 426 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01077  seryl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 449 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1402  seryl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>