More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0957 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0957  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 433 aa  879    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0437  seryl-tRNA synthetase  65.42 
 
 		 424 aa  545  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0193411  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  61.29 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 469 aa  518  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  62.21 
 
 		 431 aa  511  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 427 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  60.6 
 
 		 442 aa  508  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4753  seryl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 428 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4234  seryl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 428 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0637  seryl-tRNA synthetase  61.25 
 
 		 425 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0919244  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1688  seryl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4604  seryl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2665  seryl-tRNA synthetase  59.31 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4404  seryl-tRNA synthetase  56.08 
 
 		 468 aa  487  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  58.14 
 
 		 435 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0519  seryl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.306862  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1490  seryl-tRNA synthetase  58.29 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.693524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2787  seryl-tRNA synthetase  58.01 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3185  seryl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 434 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1477  seryl-tRNA synthetase  59.55 
 
 		 426 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1402  seryl-tRNA synthetase  59.55 
 
 		 426 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2742  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51517  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  59.75 
 
 		 426 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2282  seryl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1791  seryl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 470 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.419973  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0722  seryl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 426 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2702  seryl-tRNA synthetase  56.47 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01077  seryl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 449 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06242  seryl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 449 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13316  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0441  seryl-tRNA synthetase  54.32 
 
 		 430 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 427 aa  458  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1795  seryl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0453  seryl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393606  normal  0.0512779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3115  seryl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 474 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4414  seryl-tRNA synthetase  55.7 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.866176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0586  seryl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 461 aa  455  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64934 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0454  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.730155  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0584  seryl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1070  seryl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6577  seryl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 435 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1971  seryl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 427 aa  448  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.140828  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 427 aa  450  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7399  seryl-tRNA synthetase  58.78 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38893  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0028  seryl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2517  seryl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0204633  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 433 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  54.7 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  51.47 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 427 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  57 
 
 		 424 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 433 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1697  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0685581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  57.5 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02111  seryl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000240259  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  57.5 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2755  seryl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 426 aa  438  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 426 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 426 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>