More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0584 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0454  seryl-tRNA synthetase  86.29 
 
 
423 aa  775    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.730155  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0584  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
423 aa  878    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0028  seryl-tRNA synthetase  64.32 
 
 
425 aa  566  1e-160  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
427 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
423 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  52.36 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0957  seryl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
433 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  51.78 
 
 
427 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
425 aa  449  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4604  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4234  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4753  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
428 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
435 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1688  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
427 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2665  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
427 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1490  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 
427 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.693524  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0519  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 
425 aa  431  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.306862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2702  seryl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
436 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616472  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
420 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 
426 aa  425  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1070  seryl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
430 aa  425  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  50.72 
 
 
428 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2787  seryl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
434 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2282  seryl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
467 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0437  seryl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
424 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0193411  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0586  seryl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
461 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64934 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
423 aa  427  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3185  seryl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
434 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
417 aa  422  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  51.27 
 
 
425 aa  420  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
428 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
428 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
427 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 
424 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
428 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
432 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
428 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
428 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
428 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
424 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
428 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  52.16 
 
 
425 aa  419  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
428 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
428 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  51.78 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2429  seryl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
423 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2742  seryl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51517  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
422 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
424 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
423 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
424 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
438 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
424 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
424 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0441  seryl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
430 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285362  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
424 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
427 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1795  seryl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
430 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
424 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4414  seryl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
442 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.866176  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
424 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
425 aa  413  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
424 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
424 aa  411  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
428 aa  414  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
424 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3115  seryl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
474 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.132725 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
424 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
424 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  49.03 
 
 
438 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
428 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0453  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
430 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393606  normal  0.0512779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0722  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
426 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
428 aa  411  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6577  seryl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
435 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0637  seryl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0919244  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7399  seryl-tRNA synthetase  46.87 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
424 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
426 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  50.13 
 
 
427 aa  401  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
422 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
425 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
427 aa  403  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4404  seryl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
468 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153903  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  47.88 
 
 
427 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>