More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0028 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0028  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  881    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0584  seryl-tRNA synthetase  64.32 
 
 		 423 aa  566  1e-160  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0454  seryl-tRNA synthetase  61.74 
 
 		 423 aa  544  1e-153  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.730155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 442 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 469 aa  472  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4753  seryl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4234  seryl-tRNA synthetase  52 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4604  seryl-tRNA synthetase  52 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 425 aa  449  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0957  seryl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0519  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 425 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.306862  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1688  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0586  seryl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 461 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1070  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 417 aa  444  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0722  seryl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 426 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1490  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.693524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4414  seryl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.866176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2665  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2282  seryl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0453  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393606  normal  0.0512779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2787  seryl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2702  seryl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 436 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3185  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1795  seryl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2742  seryl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 476 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51517  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0441  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 425 aa  428  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6577  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 435 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 425 aa  428  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3115  seryl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 474 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 427 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 423 aa  420  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 427 aa  420  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 427 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0437  seryl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0193411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1791  seryl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 470 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.419973  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0637  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 425 aa  420  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0919244  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0569  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 415 aa  418  9.999999999999999e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7399  seryl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38893  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 428 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 424 aa  415  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4404  seryl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 468 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2517  seryl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 481 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0204633  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0994  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 422 aa  411  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0692  seryl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 428 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 421 aa  408  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 434 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2429  seryl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1863  seryl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.517326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>