More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0013 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  871    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  67.61 
 
 		 424 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 423 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  69.27 
 
 		 427 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  68.01 
 
 		 427 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  64.78 
 
 		 424 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  64.99 
 
 		 422 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  62.29 
 
 		 424 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 424 aa  559  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  64.66 
 
 		 423 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  61.81 
 
 		 424 aa  558  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  64.99 
 
 		 420 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 423 aa  561  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  61.58 
 
 		 424 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  61.81 
 
 		 424 aa  558  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  61.58 
 
 		 424 aa  551  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  61.14 
 
 		 422 aa  547  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 422 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 421 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  60.9 
 
 		 422 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  62.17 
 
 		 422 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  61.7 
 
 		 422 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  63.44 
 
 		 423 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  59.76 
 
 		 424 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  60.14 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  58.73 
 
 		 423 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 422 aa  523  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 425 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  59.19 
 
 		 425 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  58.29 
 
 		 423 aa  522  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  57.18 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  58.35 
 
 		 426 aa  512  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  59.81 
 
 		 423 aa  508  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 425 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  56 
 
 		 427 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 432 aa  502  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 425 aa  498  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 423 aa  494  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 423 aa  496  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 425 aa  497  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 422 aa  491  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 425 aa  488  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 428 aa  485  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 428 aa  485  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 425 aa  480  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 426 aa  481  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 427 aa  468  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 424 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  56 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 424 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 421 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 434 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 424 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 425 aa  456  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 421 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 427 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  52 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 426 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 427 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  51.15 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  52 
 
 		 426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0180  seryl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>