More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0013 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  75.24 
 
 
424 aa  687    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  75 
 
 
424 aa  683    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  75.47 
 
 
424 aa  689    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  75.47 
 
 
424 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  75.47 
 
 
424 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  75.24 
 
 
424 aa  688    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  75.47 
 
 
424 aa  689    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  75.71 
 
 
424 aa  691    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  75.47 
 
 
424 aa  689    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
424 aa  867    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  70.52 
 
 
424 aa  639    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  75.24 
 
 
424 aa  689    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  75.47 
 
 
424 aa  689    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  85.61 
 
 
424 aa  768    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  67.22 
 
 
427 aa  599  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  66.03 
 
 
424 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  66.51 
 
 
422 aa  588  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  66.27 
 
 
420 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  67.14 
 
 
427 aa  585  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  66.99 
 
 
421 aa  585  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  66.98 
 
 
423 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  65.39 
 
 
422 aa  579  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  65.72 
 
 
423 aa  579  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  63.21 
 
 
423 aa  579  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  63.68 
 
 
427 aa  569  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  63.59 
 
 
422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  63.59 
 
 
422 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  63.4 
 
 
423 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  63.12 
 
 
423 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  63.59 
 
 
422 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  63.48 
 
 
425 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  63.48 
 
 
425 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  62.65 
 
 
425 aa  553  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  61.56 
 
 
422 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 
425 aa  546  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  62.29 
 
 
423 aa  546  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  60.86 
 
 
425 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  63.59 
 
 
423 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 
424 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  61.58 
 
 
426 aa  539  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  60.38 
 
 
425 aa  536  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  58.63 
 
 
428 aa  532  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  57.68 
 
 
428 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 
427 aa  527  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  57.68 
 
 
428 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  58.37 
 
 
423 aa  526  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  59.86 
 
 
432 aa  525  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  60.47 
 
 
423 aa  527  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 
422 aa  519  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  57.04 
 
 
427 aa  518  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  58.49 
 
 
422 aa  518  1e-146  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 
425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 
426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  58.33 
 
 
425 aa  513  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  55.58 
 
 
430 aa  508  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  58.61 
 
 
423 aa  502  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  58.13 
 
 
424 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
427 aa  501  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  56.94 
 
 
417 aa  501  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  55.42 
 
 
428 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  57.52 
 
 
427 aa  495  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  55.64 
 
 
435 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  57.62 
 
 
425 aa  489  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
428 aa  486  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 
428 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
426 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  54.11 
 
 
438 aa  482  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  54.46 
 
 
427 aa  481  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  56.44 
 
 
427 aa  484  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
424 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  57.44 
 
 
436 aa  482  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  55.32 
 
 
426 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  54.46 
 
 
426 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 
434 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  53.04 
 
 
428 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 
433 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
426 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02111  seryl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
430 aa  477  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000240259  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
426 aa  477  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
424 aa  476  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  54.11 
 
 
438 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  55.87 
 
 
427 aa  476  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
428 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
432 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  55.19 
 
 
428 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  54.72 
 
 
428 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  53.65 
 
 
433 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  54.25 
 
 
428 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
433 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  53.65 
 
 
431 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
428 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
428 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
433 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
428 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  53.76 
 
 
426 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  54.72 
 
 
428 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  54.72 
 
 
428 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
433 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
433 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  54.72 
 
 
428 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>