More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3466 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1426  seryl-tRNA synthetase  75.53 
 
 		 426 aa  660    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  93.16 
 
 		 424 aa  818    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 424 aa  867    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 423 aa  537  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4342  seryl-tRNA synthetase  61.14 
 
 		 422 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  58.03 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_516  seryl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 424 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 424 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  54.59 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 425 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 423 aa  448  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 422 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 420 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  52 
 
 		 424 aa  438  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 426 aa  435  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 422 aa  431  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 425 aa  430  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 425 aa  428  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 425 aa  425  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 426 aa  421  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 422 aa  420  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 426 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 426 aa  411  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1968  seryl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.355575  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 421 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 438 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 421 aa  410  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 421 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3853  seryl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 426 aa  398  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 424 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>