More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0287 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  80.33 
 
 		 422 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  77.96 
 
 		 423 aa  673    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 422 aa  869    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  79.86 
 
 		 422 aa  710    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  79.62 
 
 		 422 aa  706    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  75.06 
 
 		 422 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  70.38 
 
 		 423 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  71.09 
 
 		 423 aa  601  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  65.63 
 
 		 424 aa  568  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 423 aa  564  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  64.93 
 
 		 423 aa  565  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  64.22 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 424 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  63.72 
 
 		 424 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 424 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 424 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 424 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  63.72 
 
 		 424 aa  555  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 424 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 424 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 424 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 424 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  63.25 
 
 		 424 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  62.83 
 
 		 422 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  63.59 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  62.62 
 
 		 424 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  60.9 
 
 		 425 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  59.24 
 
 		 427 aa  537  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  60.19 
 
 		 426 aa  532  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  61.85 
 
 		 427 aa  532  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  61.85 
 
 		 425 aa  528  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  60.66 
 
 		 424 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  61.39 
 
 		 421 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 420 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 423 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  61.06 
 
 		 423 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  58.77 
 
 		 423 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 425 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 425 aa  510  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 422 aa  501  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 422 aa  501  1e-140  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 426 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  57.76 
 
 		 425 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  57.76 
 
 		 425 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 430 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 425 aa  480  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 424 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 427 aa  473  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 424 aa  470  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 428 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 427 aa  465  9.999999999999999e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 428 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 428 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 428 aa  460  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 426 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 426 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  54.35 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 436 aa  456  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 421 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 426 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 421 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 433 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 433 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 432 aa  448  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>