More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0014 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  99.53 
 
 		 425 aa  873    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  876    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  66.35 
 
 		 423 aa  600  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 423 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  65.24 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  65 
 
 		 424 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  63.48 
 
 		 424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  64.52 
 
 		 424 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  64.76 
 
 		 424 aa  568  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  64.76 
 
 		 424 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  64.76 
 
 		 424 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  64.76 
 
 		 424 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  65 
 
 		 424 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  64.76 
 
 		 424 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  64.76 
 
 		 424 aa  569  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  64.29 
 
 		 424 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  62.53 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 424 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  62.53 
 
 		 421 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  63.48 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  62.29 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  61.58 
 
 		 423 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 420 aa  553  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 422 aa  541  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  62.05 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 424 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 425 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 424 aa  519  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 422 aa  517  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  57.52 
 
 		 422 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 425 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 422 aa  510  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 422 aa  510  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 428 aa  501  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 422 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  57.76 
 
 		 422 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 425 aa  504  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 428 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 428 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 422 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 426 aa  496  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 423 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 425 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 425 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 423 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 430 aa  481  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 426 aa  480  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 427 aa  477  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 423 aa  475  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 427 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 426 aa  465  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 432 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 425 aa  464  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 428 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 436 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 428 aa  448  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 425 aa  449  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 427 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02111  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000240259  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>