More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0028 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  874    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  73.29 
 
 		 423 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  70.38 
 
 		 420 aa  622  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  68.87 
 
 		 424 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  66.11 
 
 		 422 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  65.38 
 
 		 424 aa  601  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  66.43 
 
 		 424 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 424 aa  594  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  66.19 
 
 		 424 aa  591  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  66.43 
 
 		 424 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  66.43 
 
 		 424 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  66.43 
 
 		 424 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  66.43 
 
 		 424 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  66.59 
 
 		 427 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  66.43 
 
 		 424 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  66.43 
 
 		 424 aa  592  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  66.19 
 
 		 424 aa  591  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 424 aa  588  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  64.13 
 
 		 421 aa  588  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  66.98 
 
 		 424 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  63.7 
 
 		 423 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  64.15 
 
 		 424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  64.42 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  64.75 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  64.66 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 422 aa  550  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 423 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 425 aa  542  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 422 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  61.06 
 
 		 422 aa  534  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  60.58 
 
 		 422 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  60.58 
 
 		 422 aa  533  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 424 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  60.82 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 423 aa  526  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  60.58 
 
 		 423 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 426 aa  527  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 425 aa  523  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  58.35 
 
 		 432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 428 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 423 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 424 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 425 aa  498  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  56.35 
 
 		 428 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  56.35 
 
 		 428 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 430 aa  501  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  56.01 
 
 		 426 aa  490  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  57.69 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  55.64 
 
 		 435 aa  487  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 426 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 428 aa  463  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 424 aa  461  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 425 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 428 aa  455  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 427 aa  451  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1075  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0171622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>