More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2307 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 424 aa  874    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  68.72 
 
 		 425 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  68.72 
 
 		 424 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  65.33 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  59.53 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  58.73 
 
 		 424 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 420 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 424 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 424 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 424 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 424 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 424 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 424 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 421 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 422 aa  484  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 423 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  55.9 
 
 		 424 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 423 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 422 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  55.84 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 422 aa  481  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 423 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  54.74 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 425 aa  476  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 425 aa  474  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 423 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 427 aa  472  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 423 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 423 aa  451  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  52 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2315  seryl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00701941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 426 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 426 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 427 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 427 aa  438  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  52.21 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 426 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  441  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02111  seryl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000240259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2257  seryl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>