More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0097 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
435 aa  905    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  65.4 
 
 
425 aa  581  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  64.32 
 
 
425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  62.41 
 
 
436 aa  557  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  60.43 
 
 
423 aa  550  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  61.16 
 
 
435 aa  538  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  58.63 
 
 
424 aa  509  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  56.13 
 
 
424 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0440  seryl-tRNA synthetase  58.31 
 
 
439 aa  502  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  56 
 
 
428 aa  496  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  56.26 
 
 
424 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
428 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
428 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  55.79 
 
 
424 aa  484  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 
427 aa  485  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  55.32 
 
 
424 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
424 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  55.79 
 
 
424 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  55.79 
 
 
424 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  55.79 
 
 
424 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  55.79 
 
 
424 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  55.77 
 
 
422 aa  482  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  55.64 
 
 
424 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
424 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  56.03 
 
 
424 aa  484  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
424 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  54.91 
 
 
427 aa  484  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  55.32 
 
 
424 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  52.25 
 
 
427 aa  471  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  54.09 
 
 
420 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  53.55 
 
 
421 aa  471  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  55.64 
 
 
423 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
423 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 
427 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
424 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
426 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  53.43 
 
 
422 aa  455  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  52.69 
 
 
432 aa  458  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  51.3 
 
 
423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 
425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  51.05 
 
 
426 aa  448  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
422 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  52.24 
 
 
423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  52.94 
 
 
423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 
424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
422 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  51.77 
 
 
422 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  51.89 
 
 
423 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
432 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
427 aa  436  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
425 aa  435  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
425 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
428 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
425 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
423 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
430 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
423 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
426 aa  432  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
427 aa  432  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
424 aa  432  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
425 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
427 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
423 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
427 aa  429  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
435 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
428 aa  430  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
426 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
429 aa  430  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
422 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 
426 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
426 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
433 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
469 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
433 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
433 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
433 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 
427 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 
426 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
433 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
433 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
426 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
433 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
432 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
425 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
426 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
431 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
424 aa  425  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
430 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
438 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
427 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
428 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
426 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
438 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
433 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>