More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2381 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  874    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  73.29 
 
 		 423 aa  632  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  69.98 
 
 		 420 aa  616  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  65.09 
 
 		 424 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  65.95 
 
 		 421 aa  591  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  64.45 
 
 		 423 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  64.15 
 
 		 424 aa  586  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  66.35 
 
 		 425 aa  584  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 424 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 424 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  64.22 
 
 		 424 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  63.68 
 
 		 424 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  66.59 
 
 		 425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  63.68 
 
 		 424 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  63.44 
 
 		 424 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  63.83 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 422 aa  568  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  63.21 
 
 		 424 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  63.21 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  60.66 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 425 aa  547  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 422 aa  532  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  59.24 
 
 		 422 aa  528  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 423 aa  531  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  60.66 
 
 		 423 aa  525  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  59.24 
 
 		 422 aa  521  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 422 aa  521  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 424 aa  521  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 422 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 425 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  58.29 
 
 		 423 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 422 aa  512  1e-144  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 423 aa  505  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 425 aa  501  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 425 aa  501  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 425 aa  496  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 427 aa  488  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 426 aa  488  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 430 aa  488  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 425 aa  485  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  56.87 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  55.26 
 
 		 417 aa  488  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 425 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 427 aa  481  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 421 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 421 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 423 aa  471  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 426 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 426 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 426 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  52 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 426 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 426 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 426 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 427 aa  457  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 426 aa  451  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02111  seryl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000240259  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 431 aa  448  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 427 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1339  seryl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 423 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0130081  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1278  seryl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 423 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.483732  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>