More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1621 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 436 aa  902    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 435 aa  557  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  62.38 
 
 		 423 aa  557  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  62 
 
 		 425 aa  547  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  59.67 
 
 		 425 aa  528  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  59.07 
 
 		 424 aa  510  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 424 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0440  seryl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  57.44 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 424 aa  477  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 424 aa  477  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 424 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  53.7 
 
 		 427 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 424 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 428 aa  458  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 421 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 428 aa  458  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 422 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 422 aa  450  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 425 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 425 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 423 aa  435  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 425 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 425 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 420 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 423 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 427 aa  428  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0180  seryl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420284  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 426 aa  418  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3916  seryl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 433 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 417 aa  415  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>