More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0372 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 421 aa  857    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 423 aa  474  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 426 aa  478  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  58.12 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  53.57 
 
 		 427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 425 aa  462  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 422 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 426 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 425 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 426 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 426 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 427 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 426 aa  448  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 423 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 433 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 426 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0180  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1278  seryl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.483732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 424 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1339  seryl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0130081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 426 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 426 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 426 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 424 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 439 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 421 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 426 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 424 aa  438  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1417  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 430 aa  438  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 426 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 422 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1075  seryl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0171622  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4028  seryl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 422 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 438 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1392  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 452 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  50.12 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 425 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 423 aa  434  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>