More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0722 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  74.41 
 
 		 426 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0722  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 426 aa  862    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0637  seryl-tRNA synthetase  70.82 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0919244  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 469 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 425 aa  528  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3115  seryl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 474 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2702  seryl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 436 aa  518  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0453  seryl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 430 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393606  normal  0.0512779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1795  seryl-tRNA synthetase  61.83 
 
 		 430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  61.83 
 
 		 435 aa  513  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2665  seryl-tRNA synthetase  60.52 
 
 		 427 aa  511  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873953  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0441  seryl-tRNA synthetase  61.36 
 
 		 430 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1688  seryl-tRNA synthetase  60.76 
 
 		 427 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 442 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0519  seryl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 425 aa  508  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.306862  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4604  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 428 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4234  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 428 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1490  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 427 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.693524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4753  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 428 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  60.76 
 
 		 423 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  60.28 
 
 		 427 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2787  seryl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  60.88 
 
 		 431 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  59.91 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4404  seryl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 468 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2742  seryl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 476 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51517  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1070  seryl-tRNA synthetase  59.72 
 
 		 430 aa  486  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4414  seryl-tRNA synthetase  57.57 
 
 		 442 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.866176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3185  seryl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1791  seryl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.419973  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0586  seryl-tRNA synthetase  60.59 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64934 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1863  seryl-tRNA synthetase  60.28 
 
 		 431 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.517326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2282  seryl-tRNA synthetase  57.75 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003876  seryl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 435 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00729663  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0994  seryl-tRNA synthetase  58.31 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6577  seryl-tRNA synthetase  60.79 
 
 		 435 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0957  seryl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2429  seryl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7399  seryl-tRNA synthetase  60.74 
 
 		 437 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  57.94 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01800  seryl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0692  seryl-tRNA synthetase  58.1 
 
 		 431 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 435 aa  458  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0437  seryl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 424 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0193411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 431 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 432 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0028  seryl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  55.84 
 
 		 426 aa  441  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2755  seryl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 439 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1844  seryl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 435 aa  441  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0308873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 438 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3651  seryl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0461818  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 430 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 430 aa  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 430 aa  438  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3335  seryl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  53.15 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 430 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 430 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  53.15 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 430 aa  438  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1402  seryl-tRNA synthetase  55.26 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 468 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 430 aa  438  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>