More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2282 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4234  seryl-tRNA synthetase  78.4 
 
 		 428 aa  711    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2282  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 467 aa  955    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4604  seryl-tRNA synthetase  78.4 
 
 		 428 aa  711    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4753  seryl-tRNA synthetase  78.97 
 
 		 428 aa  708    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7399  seryl-tRNA synthetase  76.06 
 
 		 437 aa  630  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6577  seryl-tRNA synthetase  74.27 
 
 		 435 aa  619  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2742  seryl-tRNA synthetase  63.5 
 
 		 476 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51517  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1791  seryl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 470 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.419973  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2787  seryl-tRNA synthetase  66.89 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  66.21 
 
 		 435 aa  580  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3185  seryl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 434 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4414  seryl-tRNA synthetase  65.55 
 
 		 442 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.866176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2517  seryl-tRNA synthetase  63.67 
 
 		 481 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0204633  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4404  seryl-tRNA synthetase  63.09 
 
 		 468 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2702  seryl-tRNA synthetase  64.94 
 
 		 436 aa  557  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0586  seryl-tRNA synthetase  65.1 
 
 		 461 aa  544  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64934 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  61.69 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  62.53 
 
 		 431 aa  537  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1776  seryl-tRNA synthetase  58.27 
 
 		 497 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0925083  decreased coverage  0.00473675 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  61.38 
 
 		 427 aa  531  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1688  seryl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 442 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1490  seryl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 427 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.693524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2665  seryl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873953  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  58.48 
 
 		 425 aa  508  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3115  seryl-tRNA synthetase  55.39 
 
 		 474 aa  497  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132725 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0722  seryl-tRNA synthetase  57.75 
 
 		 426 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0453  seryl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 430 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393606  normal  0.0512779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1795  seryl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0441  seryl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0957  seryl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 426 aa  481  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0437  seryl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 424 aa  471  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0193411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0519  seryl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.306862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0637  seryl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 425 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0919244  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 423 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1070  seryl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0994  seryl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1863  seryl-tRNA synthetase  53.91 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.517326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_002978  WD0028  seryl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 425 aa  438  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2429  seryl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0454  seryl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 423 aa  432  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.730155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 430 aa  435  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0584  seryl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 428 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01077  seryl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 428 aa  425  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06242  seryl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13316  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1402  seryl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 426 aa  418  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 427 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1477  seryl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0180  seryl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 456 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>