99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44160 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  45.08 
 
 
196 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  44.83 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  42.31 
 
 
199 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  41.01 
 
 
188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  43.58 
 
 
197 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  43.18 
 
 
196 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  39.78 
 
 
201 aa  119  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  36.96 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  35.29 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  42.61 
 
 
206 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  36.93 
 
 
225 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  33.69 
 
 
204 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  40.61 
 
 
239 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  40.61 
 
 
238 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  36 
 
 
253 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  40.61 
 
 
238 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  37.21 
 
 
248 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  40.12 
 
 
252 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  40.61 
 
 
240 aa  95.5  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  40.12 
 
 
252 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  40.12 
 
 
252 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  40.12 
 
 
256 aa  94.4  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  40.12 
 
 
256 aa  94.4  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  40.12 
 
 
256 aa  94.4  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  40.12 
 
 
239 aa  94.4  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  38.41 
 
 
197 aa  91.7  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  37.72 
 
 
240 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  38.29 
 
 
264 aa  91.3  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  37.13 
 
 
242 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  36.57 
 
 
250 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  34.22 
 
 
207 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  33.87 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  36.65 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  37.91 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  36 
 
 
233 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  33.69 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  29.63 
 
 
212 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  27.68 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  33.68 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  32.12 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  31.77 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  36.02 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  24.34 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  28.92 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  33.51 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  34.74 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  33.15 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  32.22 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  31.09 
 
 
222 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  24 
 
 
241 aa  61.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  23.96 
 
 
211 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  30.86 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  21.91 
 
 
199 aa  60.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  34.46 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  36.52 
 
 
236 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  28.93 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  26.26 
 
 
236 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  26.26 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  29.58 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  25.39 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  31.51 
 
 
202 aa  52  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  27.08 
 
 
210 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  31.87 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  23.08 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  28.87 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  30.39 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  24.48 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  29.9 
 
 
201 aa  48.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  25.7 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  24.35 
 
 
197 aa  48.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  32.79 
 
 
212 aa  47.8  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  23.62 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  24.84 
 
 
242 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  27.27 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  26.57 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  24.73 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  26.38 
 
 
214 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  25.82 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  25.77 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  22.86 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  25.77 
 
 
251 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  25.77 
 
 
251 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  21.23 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  27.89 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  31.69 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  28.28 
 
 
221 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  25.51 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  27.68 
 
 
187 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  27.68 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  27.68 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  27.68 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  27.68 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  27.68 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  27.68 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  24.14 
 
 
185 aa  41.6  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  22.75 
 
 
213 aa  41.2  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4622  hypothetical protein  29.8 
 
 
214 aa  41.2  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  22.75 
 
 
213 aa  41.2  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>