62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0230 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  96.68 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  31.02 
 
 		 201 aa  105  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  29.73 
 
 		 203 aa  95.1  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  28.28 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  26.52 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  25.82 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  24.34 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  21.74 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  27.14 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  30.4 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  24.06 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  23.96 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  21.62 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  23.96 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  23.96 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  23.96 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  23.96 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  28.47 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  25.83 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  26.32 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  26.32 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  26.32 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  26.32 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  24.04 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  25.49 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  24.49 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  24.49 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  26.21 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  26.21 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  23.43 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  22.92 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  21.08 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  22.92 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  23.12 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  22.3 
 
 		 205 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  22.87 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  24 
 
 		 192 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  29.66 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  20.74 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  22.94 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  27.96 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  31.68 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3329  hypothetical protein  22.98 
 
 		 185 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.488614  normal  0.577133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  22.99 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  23.33 
 
 		 192 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  26.83 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  23.33 
 
 		 192 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  30.21 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  23.46 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  22.16 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  21.21 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  22.78 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  21.3 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  20.33 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  21.21 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  21.3 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  23.96 
 
 		 194 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  19.9 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>