87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1982 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  37.04 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  43.88 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  34.08 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  32.97 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  28.95 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  31.52 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  30.2 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  32.24 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  33.54 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  32.12 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  31.75 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  30.29 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  25.65 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  31.87 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  22.16 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  26.82 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  30 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  32.85 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  26.94 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  32.62 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  22.7 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  22.7 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  29.83 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  23.02 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  28.79 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  23.02 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  23.02 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  30.89 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  26.2 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  23.02 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  29.83 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  28.79 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  23.02 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  23.02 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  26.67 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  23.02 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  28.81 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  29.21 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  23.94 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  23.53 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  30 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  32.04 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  27.84 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  23.04 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  23.04 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  23.04 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  23.04 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  23.04 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  23.91 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  26.2 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  26.35 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  26.35 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  26.35 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  23.84 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  24.29 
 
 		 240 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  31.65 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  26.35 
 
 		 238 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  26.32 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  26.32 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  22.22 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  30.05 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  30.5 
 
 		 232 aa  44.7  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  19.79 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  23.08 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  23.08 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  24.23 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  23.81 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  25.31 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  24.11 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3329  hypothetical protein  27.88 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.488614  normal  0.577133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  24.74 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  22.36 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  23.08 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  22.96 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  24.1 
 
 		 225 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  24.63 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  23.89 
 
 		 192 aa  42  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  26.32 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  26.58 
 
 		 241 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  26.62 
 
 		 250 aa  41.6  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  32.61 
 
 		 242 aa  41.6  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>