18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3377 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  26.26 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  32.05 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  31.47 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  31.37 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  29.81 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  31.16 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  33.12 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  30.77 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  36.27 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  34.31 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  25.79 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  25.79 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  26.47 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  31.37 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  29.7 
 
 		 232 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  27.59 
 
 		 197 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>