85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5507 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  76.76 
 
 		 196 aa  269  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  54.44 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  44.83 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  45.95 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  44.51 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  36.5 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  37.11 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  39.5 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  37.82 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  34.57 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  39.08 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  37.89 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  39.16 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  37.35 
 
 		 238 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  37.35 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  37.35 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  36.25 
 
 		 243 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  36.14 
 
 		 240 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  34.07 
 
 		 253 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  38.67 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  35.29 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  32.97 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  38.41 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  34.76 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  32.76 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  37.02 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  31.03 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  31.68 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  32.11 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  31.25 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  31.87 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  32.56 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  32.34 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  32.34 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  32.34 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  32.34 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  32.34 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  29.76 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  32.34 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  32.34 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  29.86 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  30.56 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  32.17 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  28.44 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  30.51 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  35.05 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  31.67 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  31.43 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  29.38 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  30.69 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  26.18 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  30.5 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  29.09 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  25.56 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  27.38 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  28.89 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  23.26 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  25.58 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  26.39 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  28.43 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  26.39 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  33.12 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  31.25 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  20.67 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  28.65 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  30.49 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  34.88 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  25.52 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  27.74 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2085  hypothetical protein  30.3 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.839519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  22.87 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  23.94 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  26.62 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  27.74 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4622  hypothetical protein  25.27 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  26.11 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  26.09 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  26.09 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  21.74 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  20.14 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  21.81 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  26.09 
 
 		 214 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  29.35 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>