57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6349 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  39.78 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  37.89 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  33.72 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  36.93 
 
 		 192 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  32.42 
 
 		 197 aa  98.6  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  32.22 
 
 		 196 aa  95.5  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  27.84 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  32.29 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  34.64 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  29.84 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  34.33 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  34.33 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  34.33 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  34.33 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  34.33 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  34.33 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  34.33 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  32.37 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  29.06 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  30.67 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  31.85 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  32.05 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  32.05 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  32.09 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  35.25 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  32.05 
 
 		 238 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  31.41 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  29.92 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.67 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  28.42 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  36.11 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  30.73 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  32.02 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  25.79 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  35.71 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  27.41 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  28.24 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  22.6 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  25.53 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  29.14 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  29.73 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2085  hypothetical protein  28.93 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.839519  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  23.71 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  23.71 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  26.29 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  23.18 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  26.84 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  25.66 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  27.59 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  29.9 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  30.52 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  19.79 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  24.1 
 
 		 195 aa  42  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  26.67 
 
 		 198 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  24.87 
 
 		 188 aa  41.6  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>