101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0404 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  413  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  39.67 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  38.42 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  39.49 
 
 		 212 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  36.96 
 
 		 192 aa  114  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  38.2 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  34.57 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  37.3 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  34.22 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  34.95 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  33.33 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  29.35 
 
 		 241 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  28.32 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  40.15 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  28.57 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  29.41 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  31.75 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  26.24 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  28.95 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  32.17 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  26.11 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  26.63 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  32.97 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  33.77 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  26.23 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  28.24 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  27.69 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  32.05 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  28.74 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  26.67 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  29.24 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  29.17 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  30.06 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  27.66 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  28 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  28.75 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  27.22 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  29.81 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  26.04 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  25.42 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  25.4 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  24.26 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  31.21 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  28.87 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  26.79 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  24.47 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  24.47 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  24.47 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  24.47 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  24.47 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  26.79 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  26.79 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  27.39 
 
 		 243 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  28.47 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  26.59 
 
 		 242 aa  51.6  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  22.6 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  28.08 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  25.88 
 
 		 239 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  27.54 
 
 		 236 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  25.16 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  25.88 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  25.88 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  25.88 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  25.88 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  25.88 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  25.88 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  23.74 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  30.15 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  26.19 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  30.22 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  24.47 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  24.08 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  24.58 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  24.62 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  23.94 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  23.94 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  23.94 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  23.94 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  24.46 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  25.4 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  24.86 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  23.94 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  24.46 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  23.4 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  25.84 
 
 		 264 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  23.6 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  23.6 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  23.37 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  22.99 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  26.67 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  26.82 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  28.89 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  26.45 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  26.24 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  20.21 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>