41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2931 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  410  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  29.94 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  26.46 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  26.46 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  26.46 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  26.46 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  30.11 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  30.11 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  25.93 
 
 
187 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  26.95 
 
 
202 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  26.8 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  26.8 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  26.8 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  28.48 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  26.8 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  26.8 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  25.13 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  27.81 
 
 
192 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  26.8 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  26.63 
 
 
186 aa  58.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  27.87 
 
 
182 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  27.87 
 
 
182 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  26.29 
 
 
187 aa  58.2  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  26.56 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  23.73 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  23.56 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  23.98 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  24.26 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  21.97 
 
 
197 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  26.55 
 
 
188 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  23.43 
 
 
197 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  29.37 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  29.37 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  26.46 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  29.37 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  24.59 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  25.25 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  25.19 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  19.79 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  21.95 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  27.91 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>