55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1140 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  99.47 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  99.47 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  99.47 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  99.47 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  83.96 
 
 		 187 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  83.96 
 
 		 187 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  83.96 
 
 		 187 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  83.96 
 
 		 187 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  83.96 
 
 		 187 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  83.96 
 
 		 187 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  83.96 
 
 		 187 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  82.97 
 
 		 182 aa  313  8e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  82.97 
 
 		 182 aa  313  8e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  77.13 
 
 		 188 aa  309  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  59.68 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  57.29 
 
 		 192 aa  228  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  56.77 
 
 		 192 aa  225  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  56.77 
 
 		 192 aa  225  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  56.28 
 
 		 182 aa  221  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  56.28 
 
 		 182 aa  221  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  54.55 
 
 		 188 aa  210  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  53.72 
 
 		 188 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  44.62 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  43.01 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  33.16 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  30.53 
 
 		 211 aa  84.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  30.37 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  32.99 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  32.95 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  29.41 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  25.14 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  29.79 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  25.93 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  27.51 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  25.95 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  30.22 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  22.92 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  30.94 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  23.46 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  24.47 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  24.34 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  23.91 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  26.9 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  23.04 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  27.16 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  24.32 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  22.34 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  28.36 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  26.28 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  24.54 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3329  hypothetical protein  26.19 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.488614  normal  0.577133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  36.67 
 
 		 222 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>