35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1703 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  32.62 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  31.02 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  30.48 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  28.95 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  23.59 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  29.66 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  25.58 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  25.84 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  27.78 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  24.35 
 
 		 192 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  25.83 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  21.72 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  26.77 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  26.85 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  22.99 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  22.34 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  22.34 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  22.34 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  22.34 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  22.34 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  22.8 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  26.4 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  22.84 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  21.76 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  22.84 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  22.84 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  26.13 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  22.84 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  22.84 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  22.84 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  22.84 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  24.84 
 
 		 221 aa  41.2  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>