67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2723 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  34.22 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  33.69 
 
 
199 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  36.81 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  36.81 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  33.69 
 
 
197 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  35.68 
 
 
185 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  32.99 
 
 
189 aa  98.2  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  34.03 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  34.03 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  34.03 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  36.13 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  34.87 
 
 
186 aa  94.7  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  31.58 
 
 
187 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  31.58 
 
 
187 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  31.58 
 
 
187 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  31.58 
 
 
187 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  33.88 
 
 
188 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  31.05 
 
 
187 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  30.73 
 
 
188 aa  88.2  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  31.89 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  31.89 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  31.89 
 
 
182 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  31.89 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  31.89 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  31.89 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  31.89 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  31.89 
 
 
182 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  35.66 
 
 
192 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  31.89 
 
 
221 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  31.89 
 
 
187 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  30.1 
 
 
192 aa  84.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  35.95 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  30.69 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  26.32 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  26.94 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  25 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  27.89 
 
 
198 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  24.71 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  25.26 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  26.94 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  26.2 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  24.62 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  28.67 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.84 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  22.75 
 
 
199 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  22.84 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  24.5 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  24.74 
 
 
201 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  26.67 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  25.99 
 
 
238 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  26.17 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  25.99 
 
 
238 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  25.99 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  22.04 
 
 
240 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  26.71 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  25.42 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  24.82 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  24.37 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  21.69 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  22.82 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  23.46 
 
 
233 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  28.24 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  24.86 
 
 
240 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  26.37 
 
 
194 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  27.07 
 
 
214 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  25.26 
 
 
204 aa  41.6  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>