64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2126 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  57.89 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  61.45 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  62.94 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  65.06 
 
 		 239 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  65.06 
 
 		 238 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  62.18 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  64.46 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  63.86 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  62.05 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  60.36 
 
 		 264 aa  188  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  63.69 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  60.24 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  60.24 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  60.24 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  60.24 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  60.24 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  60.24 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  60.24 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  46.22 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  47.73 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  45.31 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  38.38 
 
 		 188 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  36.72 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  34.59 
 
 		 207 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  34.24 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  36.56 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  39.55 
 
 		 195 aa  95.5  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  37.7 
 
 		 196 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  37.91 
 
 		 192 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  37.02 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  34.17 
 
 		 215 aa  92.4  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  31.79 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  34.57 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  37.57 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  38.73 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  32.42 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  34.27 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  35.39 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  29.57 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  34.3 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  30.5 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  29.41 
 
 		 199 aa  72  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  29.47 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  29.56 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  30.48 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  32.02 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  31.54 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  29.94 
 
 		 197 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  30.95 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  29.84 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  32.14 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.8 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  36.84 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  27.14 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  28.18 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  26.44 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  26.35 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  28.89 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  25.17 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 206 aa  42.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  24.48 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>