59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0256 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  58.5 
 
 		 204 aa  224  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  38.41 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  29.74 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.8 
 
 		 201 aa  87.8  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  30.05 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  31.79 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  31.29 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  27.12 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  28.8 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  31.3 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  28.95 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  32.43 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  26.84 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  23.81 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  29.77 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  28.11 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  25.17 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  25.79 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  26.74 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  25.79 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  30.61 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  27.37 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  23.76 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  26.32 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  21.86 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  27.32 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  27.66 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  29.86 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  29.86 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  24.34 
 
 		 251 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  24.34 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  21.91 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  29.86 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  28.17 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  29.17 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  25 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  28.87 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  20.93 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  27.45 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  27.27 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  25.7 
 
 		 240 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  28.38 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  28.38 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  28.38 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  28.38 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  28.38 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  28.38 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  25.75 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  28.38 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  30.51 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  26.21 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  27.45 
 
 		 248 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 233 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>