52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0327 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  58.5 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  33.15 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  28.85 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  30.26 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  30.92 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  30.26 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  28.21 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  35.98 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  28.34 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  27.69 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  28.28 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  31.61 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  31.43 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  29.66 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  24.68 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  29.33 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  27.88 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  28.93 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  27.62 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  28.86 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  28.86 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  28.86 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  28.86 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  29.33 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  27.08 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  34.69 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  24.06 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  28.4 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  25.52 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  23.16 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  27.08 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  25.93 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  24.19 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  29.29 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  20.65 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  33.06 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  25.67 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  24.24 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  26.83 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  27.39 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  29.5 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  25.95 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  21.43 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  25 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  24.87 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  25.58 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  25.58 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  23.64 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  25.58 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2085  hypothetical protein  28.75 
 
 		 184 aa  42  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.839519  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  25.64 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>