41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5692 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  97.88 
 
 		 236 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  51.69 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  50.42 
 
 		 231 aa  231  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  49.17 
 
 		 237 aa  221  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  49.77 
 
 		 251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  49.77 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  51.12 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  48.42 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  48.4 
 
 		 214 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  49.11 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  29.85 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.34 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  26.92 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  26.53 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.63 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  25.34 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  32.38 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  25.47 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  30.05 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  24.23 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  28.87 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  27.75 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  25.9 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  24.24 
 
 		 196 aa  52  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  26.39 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  23.71 
 
 		 199 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  25.17 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  25.77 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  29.63 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  26.76 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  28.09 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  25.67 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  26.67 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  23.22 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  22.84 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  25.52 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  24.2 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  22.99 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  23.12 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>