43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1959 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  410  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  46.88 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  27.03 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  29.1 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  25.4 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4622  hypothetical protein  26.94 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  22.7 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  26.38 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  27.53 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  27.14 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  26.95 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  20.88 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  27.34 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  23.71 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  28.37 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  23.71 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  20.65 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  22.5 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  22.6 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  20.88 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  26.24 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  24.31 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  29.58 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  25.53 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  25.53 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  19.1 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  27.4 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  25.12 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  29.61 
 
 		 241 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  25.52 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  24.48 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  24.21 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  22.99 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  32.22 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  32.22 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  18.99 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  23.16 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  20.86 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  24.46 
 
 		 232 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 192 aa  41.6  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>