39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1714 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  35.96 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  28.5 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  31.39 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  31.39 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  39.04 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  29.37 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  31.87 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  34.33 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  32.19 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  32.19 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  30.95 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  30.46 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  30.48 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  29.29 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  33.94 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  29.81 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  26.62 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  29.65 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  28.16 
 
 		 207 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  30.32 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  35.14 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  32.82 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  27.7 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  30.82 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  32.85 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  26.96 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  25.62 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.67 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  32.85 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  32.21 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  32.38 
 
 		 194 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 252 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>