32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0600 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  57.68 
 
 		 231 aa  264  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  57.38 
 
 		 232 aa  264  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  54 
 
 		 237 aa  248  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  55.37 
 
 		 251 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  55.37 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  54.73 
 
 		 236 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  54.17 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  50.62 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  50.21 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  52.21 
 
 		 242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  27.78 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  24.53 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  33.85 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  26.62 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  29.87 
 
 		 199 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  25.25 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  28.87 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  26.49 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  25.67 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  24.37 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  23 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  24.46 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  25.23 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  27.81 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  29.44 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  28.03 
 
 		 197 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  26.74 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  27.39 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  27.63 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  26.8 
 
 		 195 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>