31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43450 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  54.1 
 
 		 232 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  53.28 
 
 		 231 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  51.64 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  52.05 
 
 		 251 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  51.64 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  53.67 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  51.48 
 
 		 237 aa  221  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  52.19 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  48.5 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  48.5 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  29.33 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  27.27 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  33.57 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  29.52 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  26.02 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  27.56 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  27.42 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  26.63 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  29.63 
 
 		 188 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  26.32 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  30.37 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  28.1 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  24.75 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  27.42 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  25.85 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  35.14 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  26.28 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  20.62 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  27.87 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  25.4 
 
 		 202 aa  42  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>