106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2634 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  39.29 
 
 		 201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  39.49 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  37.82 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  36.17 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  36.23 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  33.85 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  30.48 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  31.52 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  36.84 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  32.73 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  28.18 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  31.35 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  28.41 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  28.41 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  28.41 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  28.74 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  28.79 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  27.84 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  28.04 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  31.79 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  28.28 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  28.49 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  30.05 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  30.25 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  29.63 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  30.2 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  26.34 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  29.34 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  28.96 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  27.78 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  27.12 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  26.92 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  27.12 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  27.04 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  29.57 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  26.92 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  30.95 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  23.56 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  26.37 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  28.65 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  23.4 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  26.44 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  28.65 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  23.53 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  27.17 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  28.11 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  23.5 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  27.52 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  32.86 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  29.05 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  32.05 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  26.79 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  22.66 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  27.36 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  25.16 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  29.81 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  28.18 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  26 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  27.33 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  22.6 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  26 
 
 		 251 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  30.08 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  26.97 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  24.53 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  26.9 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  27.93 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  20.5 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  25.25 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  26.2 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  23.91 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  23.91 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  23.91 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  23.91 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  23.91 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  25.65 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  25.73 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  24.71 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  22.28 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  24.71 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  24.71 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  24.71 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  24.71 
 
 		 182 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  24.71 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  24.71 
 
 		 182 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  24.59 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  26.88 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  26.88 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  24.71 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  24.82 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  24.74 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  24.02 
 
 		 185 aa  45.4  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  25.17 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  21.46 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>