73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3341 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  460  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  98.74 
 
 
252 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  98.32 
 
 
252 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  98.74 
 
 
256 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  98.74 
 
 
256 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  98.74 
 
 
256 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  98.74 
 
 
252 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  90.06 
 
 
264 aa  297  9e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  75.14 
 
 
240 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  67.59 
 
 
238 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  75.76 
 
 
239 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  75.76 
 
 
240 aa  248  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  73.94 
 
 
242 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  66.67 
 
 
238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  76.43 
 
 
243 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  61.54 
 
 
233 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  55.28 
 
 
250 aa  203  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  63.91 
 
 
248 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  60.33 
 
 
233 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  48.59 
 
 
233 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  47.54 
 
 
253 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  48.15 
 
 
236 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  37.3 
 
 
208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  36.92 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  40.11 
 
 
192 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  38.73 
 
 
195 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  31.66 
 
 
207 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  32.45 
 
 
207 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  36.56 
 
 
211 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  34.04 
 
 
199 aa  92.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  36.2 
 
 
210 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  31.94 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  31.82 
 
 
222 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  31.82 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  34.25 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  35.14 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  29.67 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  32.45 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  34.22 
 
 
196 aa  79  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  27.69 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  32.42 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  33.73 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  32.96 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  30.77 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  33.1 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  32.08 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  28.22 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  27.23 
 
 
201 aa  62.4  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  28.8 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  33.87 
 
 
178 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.34 
 
 
203 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  31.52 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  27.27 
 
 
198 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  27.88 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.18 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  30.38 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  35 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  26.77 
 
 
204 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  30.28 
 
 
202 aa  46.2  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  26.51 
 
 
188 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  26.51 
 
 
185 aa  45.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  28.65 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  27.47 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  23.86 
 
 
211 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  32.84 
 
 
200 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  29.79 
 
 
195 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  30.85 
 
 
187 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  30.85 
 
 
187 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  30.85 
 
 
187 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  30.85 
 
 
187 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  26.57 
 
 
236 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  29.03 
 
 
188 aa  42  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  30.85 
 
 
187 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>