57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3180 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  90.34 
 
 		 207 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  37.68 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  35.9 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  37.06 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  35.53 
 
 		 191 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  35.75 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  35.75 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  37.04 
 
 		 236 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  32.98 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  32.43 
 
 		 240 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  32.4 
 
 		 250 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  30.96 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  34.08 
 
 		 248 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  33 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  34.76 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  32 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  32 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  31.61 
 
 		 242 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  34.59 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  31.43 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  30.86 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  32.73 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  34.22 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  31.43 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  31.43 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  31.43 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  31.43 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  31.43 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  31.43 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  31.43 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  31.84 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  32.46 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  28.95 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  31.25 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  31.32 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  28.67 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  25.97 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  33.75 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  26.42 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  27.23 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  27.37 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  27.23 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  29.93 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  26.8 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  27.56 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  25.27 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  24 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  23.65 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  24.49 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  26.26 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  30.43 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  26.05 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  26.32 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2085  hypothetical protein  27.86 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.839519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>