61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4001 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  90.55 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  64.13 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  57.14 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  63.16 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  63.16 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  63.16 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  60.22 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  62.57 
 
 		 238 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  60.82 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  58.91 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  58.91 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  58.91 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  60.82 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  61.18 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  61.18 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  61.18 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  60.59 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  61.11 
 
 		 243 aa  184  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  49.43 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  47.34 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  44.29 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  37.75 
 
 		 208 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  32.29 
 
 		 207 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  35.03 
 
 		 207 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  32.45 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  37.42 
 
 		 195 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  36.92 
 
 		 192 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  32.37 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  33.84 
 
 		 196 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  31.16 
 
 		 191 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  37.1 
 
 		 197 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  31.4 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  33.01 
 
 		 201 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  35.43 
 
 		 210 aa  85.9  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  32.17 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  30.94 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  35.48 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  30.27 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  26.73 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  34.64 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  29.08 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  31.82 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  30.41 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  31.25 
 
 		 176 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  28.19 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  32.35 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.73 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  27.51 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  28.69 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  27.16 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  29.83 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  27.44 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  28.18 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  26.75 
 
 		 195 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  24.73 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  23.26 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>