57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1653 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  67.43 
 
 		 186 aa  234  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  51.6 
 
 		 188 aa  187  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  52.13 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  50.83 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  181  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  181  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  47.87 
 
 		 192 aa  176  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  47.34 
 
 		 192 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  47.34 
 
 		 192 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  45.99 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  43.55 
 
 		 187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  43.55 
 
 		 187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  43.55 
 
 		 187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  43.55 
 
 		 187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  45.16 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  45.16 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  43.01 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  45.16 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  45.16 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  45.16 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  44.62 
 
 		 187 aa  161  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  44.62 
 
 		 187 aa  160  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  46.02 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  46.02 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  34.03 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  34.36 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  37.14 
 
 		 221 aa  87  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  34.22 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  32.07 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  31.52 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  29.9 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  30.64 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  25.57 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  29.07 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  28.57 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  24.16 
 
 		 241 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  30.77 
 
 		 238 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  27.6 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  30.13 
 
 		 239 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  25.27 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  30.13 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  30.13 
 
 		 240 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  30.82 
 
 		 240 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  27.84 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  23.81 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  25.73 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  30.19 
 
 		 242 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.04 
 
 		 201 aa  44.3  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  30.08 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  30.58 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  26.86 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  30.77 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  30.07 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  24.71 
 
 		 197 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  31.31 
 
 		 222 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>