51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2009 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  35.26 
 
 
186 aa  101  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  33.7 
 
 
188 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  33.15 
 
 
188 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  32.12 
 
 
211 aa  88.2  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  32.28 
 
 
185 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  33.33 
 
 
192 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  30.98 
 
 
187 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  30.98 
 
 
187 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  30.98 
 
 
187 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  30.43 
 
 
182 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  30.98 
 
 
187 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  30.43 
 
 
182 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  30.98 
 
 
187 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  32.8 
 
 
182 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  29.79 
 
 
187 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  32.8 
 
 
182 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  32.82 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  30.11 
 
 
187 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  30.11 
 
 
187 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  30.11 
 
 
187 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  30.11 
 
 
187 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  30.11 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  30.43 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  30 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  27.23 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  37.14 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  31.02 
 
 
189 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  28.57 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  31.22 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  28.42 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  29.14 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  29.44 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  24.86 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  28.25 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  25.89 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  27.19 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  29.9 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  34.65 
 
 
200 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  32.74 
 
 
197 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  27.41 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  24.1 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  27.14 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  28.72 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  28.27 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  26.52 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  25.27 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  26.74 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  24.24 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  24.88 
 
 
197 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>