85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3139 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  37.69 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  35.48 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  33.16 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  33.87 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  36.42 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  27.32 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  31.28 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  38.56 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  29.03 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  33.78 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  29.57 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  22.4 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  30.6 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  21.26 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  30.72 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  28.57 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  33.06 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  36 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  27.22 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  29.21 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  32.93 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  29.32 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  27.68 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  25.14 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  29.23 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  29.86 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  30.3 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  39.53 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  36.07 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  29.86 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  36.07 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  34.11 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  32.72 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  32.73 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  36.22 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  27.33 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  35.25 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  28.47 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  32.8 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  28.47 
 
 		 251 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  29.82 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  33.85 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  28.47 
 
 		 253 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  29.2 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  28.65 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  32.65 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  31.72 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  28.65 
 
 		 231 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  36.56 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  32.17 
 
 		 252 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  26.32 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  31.33 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  32.69 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  29.92 
 
 		 250 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  31.47 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  31.47 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  31.47 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  31.47 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  31.47 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  31.47 
 
 		 239 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  28.35 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  28.1 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  28.1 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  25.39 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  29.57 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  28.38 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  36.05 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  23.57 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  23.57 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  32.03 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  23.57 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  37.21 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  22.75 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  23.57 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  23.57 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  23.57 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  23.57 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  28.85 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  26.46 
 
 		 225 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  31.43 
 
 		 264 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  22.86 
 
 		 187 aa  42  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  25.74 
 
 		 187 aa  42  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>